🧩 🎮 퍼즐게임으로 단백질 구조 예측하기 - Foldit / “ 바이오 지식이 없는데 신약개발 연구에 기여할 수 있나요?🥹 ”

소개

‎저는 꼬리에 꼬리를 무는 탐색 과정을 좋아하는 편인데요 🙂 (약간 산만함..)

작성중이던 디지털 헬스케어 UX 사례 분석 중에 AI기반 3D 모델링 무료 툴을 접목해 프로토타이핑하고 싶다는 생각이 들어, 쉽고 재밌게 즐길 수 있는 툴을 살펴보고 싶었습니다.(좀 라이트하고 쉽게.. 게임 밸러스 요소가 들어간 무언가..를 해보고 싶었습니다)

그 과정에서 게임화된 시스템을 통해 과학적 탐구를 진행하는 사례들을 접하게 되었고, 그 중 조금 오래된 사례이긴 하지만 Foldit 사례를 공유하고 싶어 남깁니다.

진행 방법

1️⃣ ChatGPT에게 AI기반 3D 모델링 무료 툴 리스트업 부탁 -> 그 중 라이트하게 사용자가 즐길 수 있는 사례로 좁혀 달라고 함 -> 게이미피케이션 요소가 결합된 플랫폼 사례가 궁금해짐

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다양한 한국어 유형을 보여주는 표

상단 툴들 중 Foldit이 궁금해져서, Foldit에 대한 설명을 요청했고, 신약개발과의 관계성을 설명해달라고 했습니다.

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표에 있는 한국어 단어 목록

아미노산을 다양한 방법으로 조합하는 일종의 시뮬레이션 게임이네요 🧩 🎮 🕹

미국 워싱턴 대학교 연구진이 각종 바이러스, 세균의 단백질 구조와 효소 메커니즘을 위해 개발한 웹게임이라고 합니다. 

• 공식 웹사이트: https://fold.it/

https://youtu.be/b8GS9l3xZiY?si=C2agUA2SKoIj_Vu6

2️⃣ Fold It을 통해 얻은 연구적 성과 사례를 알려달라고 함

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covid-19라는 단어가 포함된 문서

3️⃣ Foldit 관련 UT(Usability Test) 내용이 궁금해서 관련 논문 검색(2019년 이후 논문 중 'Foldit Drug Game' 키워드로 검색 + HCI 관련 Top 학술지에 publish 된 사례 검색)

--> 일반인(citizen scientists)와 전문 과학자(expert scientists) 참여자의 성과를 비교한 논문을 찾게 되었습니다.

Liu, Yunchao, et al. "Foldit Drug Design Game Usability Study: Comparison of Citizen and Expert Scientists." Proceedings of the 13th ACM SIGGRAPH Conference on Motion, Interaction and Games. 2020.

--> 해당 논문에서 Foldit의 어떤 UX 요소가 참여자들의 창의성을 이끌어내고 사용성을 높였는지 분석하는 과정을 살펴보게 되었습니다.(이 논문에서는 UI 요소 분석을 위해 UX 방법론 중 Think Aloud 기법을 사용했네요.)

※ Think Aloud: 사용자가 특정 작업을 수행하는 동안 그들의 생각을 말로 표현하도록 요청 --> 각 단계마다 사용자가 왜 그런 행동을 했는지, 어떤 부분에서 어려움을 겪고 있는지를 알 수 있음

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컴퓨터 프로그램을 만드는 과정을 보여주는 다이어그램

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여러 항목이 있는 테이블

4️⃣ Foldit 계정 가입/설치 후 직접 체험해보기로 함 -> 하지만..알 수 없는 오류로 자꾸 종료가 됨..ㅠㅠ(구버전 사용 후기 인듯 하지만 사용방법과 시스템 구조 참고하실 수 있도록 관련 영상 링크를 남겨봅니다 😃 )

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솔로이스트 그룹을 이끄는 사람이 누구인지 확인하세요

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순위표 페이지의 스크린샷

아.. 저도 저 랭킹에 들고 싶었는데.. 너무 아쉽네요😆🤔

https://www.youtube.com/watch?v=V-6K613CpTM

https://www.youtube.com/watch?v=V-6K613CpTM

https://www.youtube.com/watch?v=2vGmnr6cMoc

✨ 신규 개선된 Foldit 기능에 대한 설명 자료(AI 적용)

https://www.youtube.com/watch?v=MS12lUpvK-k

--> 저는 바쁜 현대인이니 😁 YouTube Summary with ChatGPT & Claude을 이용해 영상 내용을 요약했어요!

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휴대전화의 문자 메시지 스크린샷

--> 영상 스크립트를 바탕으로 한국어로 요약해달라고 요쳥했습니다!

ChatGPT 답변:

이 영상은 "Foldit" 게임의 발전과 2023년 주요 개선 사항들을 다룹니다. 새로운 AI 도구인 '신경망 목표'와 '신경망 변이 도구'를 통해 단백질 설계와 변이를 빠르고 정확하게 진행할 수 있게 되었고, 'Trim Tool'을 이용해 더 큰 단백질 문제를 해결할 수 있게 되었습니다. 또한, 작은 분자의 약물 설계와 'Compound Library' 도구를 통한 실험적 테스트가 가능해졌습니다. 새로운 웹사이트와 3D 단백질 뷰어 기능도 추가되었습니다.

5️⃣ 집단지성 + 게임 플레이를 통해 과학적 탐구(특히 신약개발 부문)를 한 사례를 알려달라고 함

유사한 사례(게임화된 시스템을 통해 과학적 탐구를 진행하는 사례)를 추천해달라고 했습니다.

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다양한 종류의 한국어가 있는 테이블

ChatGPT는 알려주지 않았지만... Foldit과 세트로 나오는 사례가 맥길 대학교 연구진이 2010년 개발한 파일로(Phylo)였습니다. 테트리스 게임의 형식으로 복잡한 DNA 염기서열을 푸는 게임이라고 하네요.

😉그래서 왜 안알려줬냐고(?!)😟 물어봤더니 정보를 알려주네요..ㅎㅎ

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한국어 단어가 적힌 문서

결과와 배운 점

작성중이에용 🙂

도움 받은 글 (옵션)

작성중이에용 🙂