강성준
강성준
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노화 극복을 위한 콜라겐 단백질 구조 예측 🧓🏼👵🏼

소개

노화에 핵심적인 역할을 하는 단백질인 콜라겐의 중요성을 알게 되었다.

진행 방법

콜라겐 단백질 시퀀스를 모두 복사해서...

주황색과 파란색 가닥의 단백질 이미지

뭔가 이상하다..!

주황색은 예측이 정확하지 않다는 의미

클로드야 도와줘!

아하 삼중나선이구나!!

DNA 분자의 3D 모델
검정색 배경에 노란색 나선형 이미지

여전히 예측이 제대로 되지 않음

클로드 도움으로 2개의 COL1A1 + COL1A2 삼중나선도 구현해봤지만

노란색으로 예측도가 오르긴하지만 여전히 예측이 제대로 되지 않음

흡수를 위해서는 “저분자 콜라겐” 혹은 “콜라겐 펩타이드” 형태가 필요하다!

다양한 유형의 데이터를 보여주는 그래프의 스크린샷 2개

GPAGPAGPAGPA 처럼 단순한 구조의 콜라겐 펩타이드!

그러나, 이렇게 100개 30개 모인것은 저분자가 아니다.

다시한번 클로드에게 물어보고 결과적으로 12개 아미노산으로 이루어진 펩타이드구조를 제작하였다!

결과와 배운 점

결과적으로 파란색(예측이 매우 정확하게 된다는 의미)의 정확한 저분자 콜라겐 구조를 얻어낼수 있었다.

거기 더해 콜라겐의 생물학적 기능에 매우 중요한, 세포-기질 상호작용을 매개하는 결합 모티브까지도 추가할수있었다.

도움 받은 글 (옵션)

https://www.gpters.org/health/post/how-can-we-take-OlTHfOAztAbpr5M

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